讲述柯南在暂时恢复为工藤新一时，恰巧为帝丹高中校外旅行时期，一行人前往京都参访，在清水寺认识了女演员鞍知景子，新一被请托解读暗号，却在过程中遇上刹人事件，犯罪现场更留下疑似天狗袭击的痕迹。在一连串的骚动中，新一能否解开暗号，让真相拨云见日？说真的，在场的谁不害怕陈源这个帝级高手发飙？即便是对陈源恨之入骨的卫剑豹也怕，否则当初抓到苏云的时候，他也不会特意警告那些手下不许动苏云一丝一毫了。