晴朗时节，江户川柯南（高山南 配音）和毛利小五郎（小山力也 配音）、小兰（山崎和佳奈 配音）以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都，陈源，男子汉大丈夫，要一言九鼎！你刚才承诺过只要离开卫府，就放了我三妹和四弟，现在你已经出了卫府，飞车也在你眼前了，你放了我三妹，为何还扣着我四弟不放人？难道你要食言而肥？他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感觉，期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员..